9月13日0—24時，31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增確診病例10例，均為境外輸入病例（上海5例，福建2例，云南2例，廣東1例）；無新增死亡病例；新增疑似病例3例，均為境外輸入病例（均在上海）。
當日新增治愈出院病例16例，解除醫學觀察的密切接觸者650人，重癥病例與前一日持平。
境外輸入現有確診病例145例（其中重癥病例1例），現有疑似病例3例。累計確診病例2645例，累計治愈出院病例2500例，無死亡病例。
截至9月13日24時，據31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告，現有確診病例145例（其中重癥病例1例），累計治愈出院病例80415例，累計死亡病例4634例，累計報告確診病例85194例，現有疑似病例3例。累計追蹤到密切接觸者823002人，尚在醫學觀察的密切接觸者6527人。
31個省（自治區、直轄市）和新疆生產建設兵團報告新增無癥狀感染者39例（均為境外輸入）；當日轉為確診病例1例（為境外輸入）；當日解除醫學觀察18例（均為境外輸入）；尚在醫學觀察無癥狀感染者378例（境外輸入377例）。
累計收到港澳臺地區通報確診病例5501例。其中，香港特別行政區4957例（出院4630例，死亡100例），澳門特別行政區46例（出院46例），臺灣地區498例（出院475例，死亡7例）。